10 березня 2021 року Єсипенка затримали співробітники ФСБ Росії за звинуваченням у зборі інформації «в інтересах українських спецслужб» і зберіганні «саморобного вибухового пристрою» в автомобілі. У 2022 році підконтрольний РФ суд у Криму засудив Єсипенка до п'яти років позбавлення волі та штрафу в розмірі 110 тисяч рублів. Російська прокуратура вимагала для нього 11 років. Сам Єсипенко на суді заявляв, що російські силовики його катували, в тому числі електричним струмом, домагаючись зізнань. За час ув'язнення Єсипенко став лауреатом кількох престижних нагород: Free Media Award (2022), Freedom to Write Award від PEN America (2022), Національної премії імені Ігоря Лубченка, а також отримав державну стипендію імені Левка Лук'яненка, яка присуджується українським політв'язням.